เดิมชื่อสวนพฤกษศาสตร์ 100 ปี กรมป่าไม้ ตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2539 เนื่องในโอกาสกรมป่าไม้ครบรอบ 100 ปี โดยใช้พื้นที่ของเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าเขาอ่างฤาไน จำนวน 5,545 ไร่ บริเวณเขาตะกรุบ อำเภอวังน้ำเย็น จังหวัดสระแก้ว และอำเภอสนามชัยเขต จังหวัดฉะเชิงเทรา

ลักษณะภูมิประเทศ
สวนพฤกษศาสตร์วังน้ำเย็น มีอาณาเขต ดังนี้
ทิศเหนือ จดน้ำตกเขาตะกรุบ พื้นที่เกษตรกรรม
ทิศตะวันออก จดพื้นที่เกษตรกรรม และหมู่บ้าน
ทิศตะวันตก จดเขาตะกรุบ และเขตรักษาพันธุ์สัตว์ป่าอ่างฤาไน
ทิศใต้ จดทางหลวงหมายเลข 3259 สนามชัยเขต-คลองหาด
พื้นที่ส่วนใหญ่เป็นที่ราบสลับเนินเขา เนินเขาหินทราย มีที่ราบเชิงเขาทางด้านทิศตะวันออกและตะวันตก ดินเป็นดินเหนียวปนดินลูกรัง จุดสูงสุดที่ 200 เมตร จากระดับน้ำทะเลปานกลาง สภาพสังคมพืชเป็นป่าดิบแล้ง ซึ่งเป็นสภาพป่าส่วนใหญ่ของป่ารอยต่อ 5 จังหวัด

จุดเด่นที่น่าสนใจ
พรรณไม้ในสวน
พรรณไม้เดิมในพื้นเป็นพรรณไม้ในสังคมพืชป่าดิบแล้ง ซึ่งมีกว่า 440 ชนิด สำหรับพรรณไม้ที่ปลูกรวบรวมเป็นหมวดหมู่ มี 16 วงศ์ ได้แก่ วงศ์มังคุด วงศ์ตีนเป็ด วงศ์ปาล์ม วงศ์ยาง วงศ์กระดังงา วงศ์มะเมื่อย วงศ์มะเกลือ วงศ์มะม่วง วงศ์ส้ม วงศ์อบเชย วงศ์เปล้า วงศ์บอน วงศ์แค วงศ์ไทร วงศ์มะเกิ้ม และวงศ์ถั่ว นอกจากนี้ยังได้นำปรงเขาชะเมา มาปลูกประดับ ณ บริเวณหน้าอาคารศูนย์บริการข้อมูลนักท่องเที่ยว